Amblem'deki Türk Bayrağı ise Türkiye Futbol Federasyonu'nun hediyesidir.

Beşiktaş Türk Bayrağını kullanma hakkını Yunan Milli Takımıyla oynanan bir maçta Türk Milli Takımını temsil ettiği için almıştır. Başka hiçbir Türk Kulübünün
böyle bir hakkı yoktur.


         
    

 Beşiktaş Amblem'indeki ilk beyaz çizgi 1'i; 3 siyah çizgi 3'u ve ikinci beyaz çizgi 1'i simgelemektedir. Bütün Amblem 9 bölümden oluşmaktadır ve yukarıdaki
 dört numara (1.3.1.9)  yan yana geldiğinde, 1319'u oluşturmaktadır. 1319 Arapçada 1903'e eşittir.